基于中性粒细胞胞外陷阱的泛癌预后特征 - 生信豆芽菜 - 专门做分析的生信平台.

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快捷帮助

1.提取特征基因集表达矩阵

中性粒相关基因集

生存时间

2.单因素cox分析筛选预后相关的基因

导入数据

随机种子

训练集样本的比例（0-1）

3.构建风险模型

导入数据

单因素cox分析p的阈值

是否进行lasso

yes no

是否进行逐步回归

yes no

4.module基因相关性分析

导入数据

选择数据集

训练集验证集全部数据集

图片宽度(cm)

图片高度(cm)

5.风险得分预后分析的可视化

导入数据

高风险组颜色

低风险组颜色

6.风险模型的评估

导入数据

输入时间（year）

AUC的颜色

7.风险得分与血管生成、EMT和细胞周期的关系

导入数据

通过PMC3743050收集血管生成相关的基因集，通过PMID: 33677091收集EMT相关的基因集，通过PMID：29625050收集细胞周期相关的基因集

8.高低风险组差异基因的富集分析

导入数据

p值的类型

FDR Pvalue

p的阈值

Fold Change的阈值